1.延安大学医学院，陕西 延安 716000;2.空军军医大学 生物化学与分子生物学实验室，陕西 西安 710032;3.空军军医大学西京医院 神经外科，陕西 西安 710032
胡维红（1995—），女，硕士在读，主要从事胶质瘤表观遗传机制基础研究。
张静（1982—），男，教授，博士，主要从事肿瘤的表观遗传学研究，电话：
中国博士后科学基金（2019M653971）；山东省自然科学基金青年项目（ZR2020QH233）
1.Medical College of Yanan University， Yan’an， Shaanxi 716000， China;2.Department of Biochemistry and Molecular Biology， Air Force Military Medical University， Xi’an， Shaanxi 710032， China;3.Department of Neurosurgery， Xijing Institute of Clinical Neuroscience， Xijing Hospital， Air Force Military Medical University， Xi’an， Shaanxi 710032， China
- 摘要 |
- 图/表 |
- 访问统计 |
- 参考文献 |
- 相似文献 |
- 引证文献 |
- 资源附件 |
- 音频文件 |
- 视频文件
目的 探讨TRIM38基因非CpG岛DNA甲基化与胶质瘤异柠檬酸脱氢酶（IDH）基因突变之间的关系。方法 利用中国胶质瘤基因组图谱计划（CGGA）数据库的多组学数据和临床资料，比较在IDH野生型或突变型的胶质瘤中，TRIM38非CpG岛DNA甲基化的改变模式以及与基因表达和临床预后的关系。结果 共纳入CGGA胶质瘤325例及非肿瘤对照脑组织（NTB组）11例，分析发现IDH野生型胶质瘤TRIM38非CpG岛DNA甲基化和基因表达，相对NTB组分别发生低甲基化（P =0.000）和高表达（P=0.007），且两者之间呈负相关（P=0.017）。生存分析显示，TRIM38非CpG岛DNA甲基化水平与IDH野生型肿瘤的预后有关（P=0.061）。结论 IDH突变可能通过限制TRIM38基因非CpG岛DNA低甲基化介导的肿瘤促癌基因表达上调，为IDH突变相关的胶质瘤提供“保护作用”。
Objective To investigate the association between non-CpG island DNA methylation of TRIM38 and isocitrate dehydrogenase （IDH） gene mutations in glioma.Methods The multi-omics and clinical data from Chinese Glioma Genome Atlas （CGGA） were used to compare the differences in the non-CpG island DNA methylation pattern of TRIM38 and its association with gene expression and clinical prognosis between glioma with wild-type or mutant-type IDH.Results A total of 325 patients with glioma and 11 non-tumor brain （NTB） tissue samples from CGGA were included for analysis. It was found that compared with the NTB tissue samples， the glioma with wild-type IDH had a significant reduction in the non-CpG island DNA methylation of TRIM38 （P =0.000） and a significant increase in the gene expression of TRIM38 （P =0.007）， with a significant negative correlation between them （P =0.017）. The survival analysis showed that the non-CpG island DNA methylation level of TRIM38 was associated with the prognosis of glioma with wild-type IDH （P = 0.061）.Conclusions IDH mutations might exert a “protective effect” on gliomas associated with IDH mutation by inhibiting the upregulated expression of pro-oncogenic genes mediated by the non-CpG island DNA hypomethylation of TRIM38.
引用本文
胡维红,吴元明,殷安安,张静456.TRIM38非CpG岛DNA甲基化与胶质瘤异柠檬酸脱氢酶突变的关系研究[J].国际神经病学神经外科学杂志,2021,48(5):415-418111HU Wei-Hong, WU Yuan-Ming, YIN An-An, ZHANG Jing222. Association between non-CpG island DNA methylation of TRIM38 and isocitrate dehydrogenase gene mutations in glioma[J]. Journal of International Neurology and Neurosurgery,2021,48(5):415-418
复制分享
文章指标
- 点击次数:
- 下载次数:
历史
- 收稿日期:2021-04-19
- 最后修改日期:2021-09-28
- 录用日期:
- 在线发布日期: 2021-11-15
